Protein–RNA interactions for Protein: Q02246

CNTN2, Contactin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN2Q02246 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CNTN2Q02246 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
CNTN2Q02246 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CNTN2Q02246 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CNTN2Q02246 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CNTN2Q02246 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CNTN2Q02246 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CNTN2Q02246 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CNTN2Q02246 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CNTN2Q02246 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CNTN2Q02246 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CNTN2Q02246 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CNTN2Q02246 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CNTN2Q02246 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CNTN2Q02246 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CNTN2Q02246 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CNTN2Q02246 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms