Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.1 ms