Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
XPCQ01831 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
XPCQ01831 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
XPCQ01831 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
XPCQ01831 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
XPCQ01831 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
XPCQ01831 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
XPCQ01831 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
XPCQ01831 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
XPCQ01831 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
XPCQ01831 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
XPCQ01831 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
XPCQ01831 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
XPCQ01831 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
XPCQ01831 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
XPCQ01831 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
XPCQ01831 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
XPCQ01831 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
XPCQ01831 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
XPCQ01831 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
XPCQ01831 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
XPCQ01831 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
XPCQ01831 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
XPCQ01831 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
XPCQ01831 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
XPCQ01831 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
XPCQ01831 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
XPCQ01831 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
XPCQ01831 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
XPCQ01831 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
XPCQ01831 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
XPCQ01831 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
XPCQ01831 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
XPCQ01831 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
XPCQ01831 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
XPCQ01831 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
XPCQ01831 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
XPCQ01831 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
XPCQ01831 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
XPCQ01831 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
XPCQ01831 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
XPCQ01831 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
XPCQ01831 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
XPCQ01831 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
XPCQ01831 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
XPCQ01831 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
XPCQ01831 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
XPCQ01831 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
XPCQ01831 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
XPCQ01831 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
XPCQ01831 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
XPCQ01831 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
XPCQ01831 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
XPCQ01831 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
XPCQ01831 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
XPCQ01831 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
XPCQ01831 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
XPCQ01831 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
XPCQ01831 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
XPCQ01831 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
XPCQ01831 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
XPCQ01831 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
XPCQ01831 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
XPCQ01831 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
XPCQ01831 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
XPCQ01831 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
XPCQ01831 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
XPCQ01831 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
XPCQ01831 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
XPCQ01831 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
XPCQ01831 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
XPCQ01831 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
XPCQ01831 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
XPCQ01831 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
XPCQ01831 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
XPCQ01831 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
XPCQ01831 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
XPCQ01831 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
XPCQ01831 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
XPCQ01831 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
XPCQ01831 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
XPCQ01831 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
XPCQ01831 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
XPCQ01831 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
XPCQ01831 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
XPCQ01831 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
XPCQ01831 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
XPCQ01831 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
XPCQ01831 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
XPCQ01831 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
XPCQ01831 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
XPCQ01831 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
XPCQ01831 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
XPCQ01831 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
XPCQ01831 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
XPCQ01831 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
XPCQ01831 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
XPCQ01831 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
XPCQ01831 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
XPCQ01831 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms