Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms