Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms