Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRX1P78414 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRX1P78414 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRX1P78414 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRX1P78414 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRX1P78414 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRX1P78414 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRX1P78414 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRX1P78414 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRX1P78414 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRX1P78414 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRX1P78414 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRX1P78414 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRX1P78414 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
IRX1P78414 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRX1P78414 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRX1P78414 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRX1P78414 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRX1P78414 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRX1P78414 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRX1P78414 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRX1P78414 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRX1P78414 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRX1P78414 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRX1P78414 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRX1P78414 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRX1P78414 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
IRX1P78414 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRX1P78414 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRX1P78414 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRX1P78414 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRX1P78414 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRX1P78414 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRX1P78414 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRX1P78414 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRX1P78414 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRX1P78414 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRX1P78414 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRX1P78414 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRX1P78414 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRX1P78414 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRX1P78414 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRX1P78414 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
IRX1P78414 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRX1P78414 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRX1P78414 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRX1P78414 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRX1P78414 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRX1P78414 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRX1P78414 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRX1P78414 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
IRX1P78414 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRX1P78414 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRX1P78414 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRX1P78414 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRX1P78414 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRX1P78414 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRX1P78414 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRX1P78414 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRX1P78414 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRX1P78414 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRX1P78414 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRX1P78414 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRX1P78414 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRX1P78414 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRX1P78414 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRX1P78414 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRX1P78414 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRX1P78414 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRX1P78414 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRX1P78414 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRX1P78414 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRX1P78414 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRX1P78414 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRX1P78414 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRX1P78414 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRX1P78414 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRX1P78414 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
IRX1P78414 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRX1P78414 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRX1P78414 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRX1P78414 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRX1P78414 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRX1P78414 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRX1P78414 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRX1P78414 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
IRX1P78414 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRX1P78414 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRX1P78414 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRX1P78414 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRX1P78414 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRX1P78414 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRX1P78414 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRX1P78414 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRX1P78414 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRX1P78414 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRX1P78414 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRX1P78414 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRX1P78414 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRX1P78414 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms