Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERVK_113P63132 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERVK_113P63132 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERVK_113P63132 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERVK_113P63132 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERVK_113P63132 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERVK_113P63132 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERVK_113P63132 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
HERVK_113P63132 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERVK_113P63132 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERVK_113P63132 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERVK_113P63132 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERVK_113P63132 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERVK_113P63132 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
HERVK_113P63132 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERVK_113P63132 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERVK_113P63132 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERVK_113P63132 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERVK_113P63132 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERVK_113P63132 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERVK_113P63132 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERVK_113P63132 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERVK_113P63132 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERVK_113P63132 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERVK_113P63132 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERVK_113P63132 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERVK_113P63132 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERVK_113P63132 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERVK_113P63132 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERVK_113P63132 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERVK_113P63132 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HERVK_113P63132 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HERVK_113P63132 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HERVK_113P63132 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HERVK_113P63132 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HERVK_113P63132 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HERVK_113P63132 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HERVK_113P63132 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HERVK_113P63132 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HERVK_113P63132 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HERVK_113P63132 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HERVK_113P63132 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HERVK_113P63132 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HERVK_113P63132 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HERVK_113P63132 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HERVK_113P63132 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HERVK_113P63132 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HERVK_113P63132 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HERVK_113P63132 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
HERVK_113P63132 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HERVK_113P63132 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HERVK_113P63132 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HERVK_113P63132 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HERVK_113P63132 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HERVK_113P63132 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
HERVK_113P63132 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HERVK_113P63132 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HERVK_113P63132 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HERVK_113P63132 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HERVK_113P63132 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HERVK_113P63132 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
HERVK_113P63132 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HERVK_113P63132 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HERVK_113P63132 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HERVK_113P63132 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HERVK_113P63132 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HERVK_113P63132 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HERVK_113P63132 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
HERVK_113P63132 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HERVK_113P63132 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HERVK_113P63132 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HERVK_113P63132 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HERVK_113P63132 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HERVK_113P63132 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HERVK_113P63132 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HERVK_113P63132 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HERVK_113P63132 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HERVK_113P63132 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HERVK_113P63132 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HERVK_113P63132 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HERVK_113P63132 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HERVK_113P63132 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HERVK_113P63132 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HERVK_113P63132 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HERVK_113P63132 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HERVK_113P63132 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HERVK_113P63132 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HERVK_113P63132 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HERVK_113P63132 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HERVK_113P63132 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
HERVK_113P63132 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms