Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP107P57740 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP107P57740 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP107P57740 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP107P57740 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP107P57740 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP107P57740 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP107P57740 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP107P57740 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP107P57740 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP107P57740 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP107P57740 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP107P57740 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP107P57740 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP107P57740 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP107P57740 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP107P57740 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP107P57740 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP107P57740 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP107P57740 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP107P57740 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP107P57740 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP107P57740 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP107P57740 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP107P57740 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP107P57740 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP107P57740 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP107P57740 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP107P57740 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP107P57740 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP107P57740 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP107P57740 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NUP107P57740 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NUP107P57740 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NUP107P57740 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NUP107P57740 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NUP107P57740 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
NUP107P57740 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NUP107P57740 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NUP107P57740 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NUP107P57740 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NUP107P57740 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NUP107P57740 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NUP107P57740 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NUP107P57740 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NUP107P57740 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NUP107P57740 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP107P57740 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP107P57740 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP107P57740 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP107P57740 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP107P57740 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP107P57740 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP107P57740 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP107P57740 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP107P57740 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP107P57740 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP107P57740 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP107P57740 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP107P57740 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP107P57740 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP107P57740 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP107P57740 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP107P57740 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP107P57740 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP107P57740 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP107P57740 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP107P57740 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP107P57740 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP107P57740 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP107P57740 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP107P57740 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP107P57740 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP107P57740 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP107P57740 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP107P57740 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP107P57740 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP107P57740 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP107P57740 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP107P57740 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP107P57740 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP107P57740 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP107P57740 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP107P57740 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP107P57740 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP107P57740 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP107P57740 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP107P57740 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP107P57740 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP107P57740 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP107P57740 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP107P57740 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP107P57740 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP107P57740 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP107P57740 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP107P57740 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP107P57740 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP107P57740 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP107P57740 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP107P57740 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms