Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GTF2A2P52657 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GTF2A2P52657 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GTF2A2P52657 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GTF2A2P52657 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GTF2A2P52657 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GTF2A2P52657 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GTF2A2P52657 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GTF2A2P52657 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
GTF2A2P52657 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GTF2A2P52657 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2A2P52657 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2A2P52657 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2A2P52657 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2A2P52657 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms