Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERFP50548 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERFP50548 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ERFP50548 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERFP50548 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERFP50548 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERFP50548 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERFP50548 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERFP50548 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERFP50548 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERFP50548 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERFP50548 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERFP50548 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERFP50548 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERFP50548 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERFP50548 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ERFP50548 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERFP50548 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERFP50548 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERFP50548 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERFP50548 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERFP50548 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERFP50548 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERFP50548 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERFP50548 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERFP50548 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERFP50548 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERFP50548 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERFP50548 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERFP50548 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERFP50548 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ERFP50548 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERFP50548 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERFP50548 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERFP50548 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ERFP50548 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERFP50548 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERFP50548 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERFP50548 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERFP50548 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERFP50548 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERFP50548 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERFP50548 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERFP50548 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERFP50548 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERFP50548 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERFP50548 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERFP50548 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERFP50548 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERFP50548 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERFP50548 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERFP50548 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERFP50548 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERFP50548 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERFP50548 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERFP50548 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERFP50548 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERFP50548 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERFP50548 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERFP50548 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERFP50548 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERFP50548 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERFP50548 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERFP50548 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERFP50548 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERFP50548 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERFP50548 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERFP50548 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERFP50548 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERFP50548 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERFP50548 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERFP50548 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERFP50548 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ERFP50548 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERFP50548 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERFP50548 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERFP50548 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERFP50548 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERFP50548 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERFP50548 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERFP50548 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERFP50548 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERFP50548 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERFP50548 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERFP50548 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERFP50548 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERFP50548 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERFP50548 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERFP50548 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERFP50548 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERFP50548 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERFP50548 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERFP50548 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERFP50548 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERFP50548 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERFP50548 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERFP50548 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERFP50548 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERFP50548 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERFP50548 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms