Protein–RNA interactions for Protein: P49418

AMPH, Amphiphysin, humanhuman

Predictions only

Length 695 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMPHP49418 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
AMPHP49418 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AMPHP49418 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AMPHP49418 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AMPHP49418 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AMPHP49418 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AMPHP49418 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
AMPHP49418 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AMPHP49418 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AMPHP49418 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AMPHP49418 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
AMPHP49418 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
AMPHP49418 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AMPHP49418 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AMPHP49418 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AMPHP49418 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AMPHP49418 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AMPHP49418 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AMPHP49418 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AMPHP49418 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AMPHP49418 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AMPHP49418 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AMPHP49418 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AMPHP49418 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AMPHP49418 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AMPHP49418 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AMPHP49418 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AMPHP49418 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AMPHP49418 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AMPHP49418 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AMPHP49418 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AMPHP49418 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AMPHP49418 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AMPHP49418 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AMPHP49418 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AMPHP49418 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AMPHP49418 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AMPHP49418 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AMPHP49418 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AMPHP49418 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AMPHP49418 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
AMPHP49418 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
AMPHP49418 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AMPHP49418 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AMPHP49418 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AMPHP49418 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AMPHP49418 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AMPHP49418 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AMPHP49418 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AMPHP49418 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
AMPHP49418 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AMPHP49418 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AMPHP49418 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AMPHP49418 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AMPHP49418 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AMPHP49418 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AMPHP49418 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AMPHP49418 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AMPHP49418 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AMPHP49418 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AMPHP49418 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AMPHP49418 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AMPHP49418 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AMPHP49418 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AMPHP49418 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AMPHP49418 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AMPHP49418 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AMPHP49418 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
AMPHP49418 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
AMPHP49418 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AMPHP49418 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AMPHP49418 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AMPHP49418 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AMPHP49418 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AMPHP49418 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AMPHP49418 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AMPHP49418 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AMPHP49418 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AMPHP49418 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AMPHP49418 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AMPHP49418 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AMPHP49418 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AMPHP49418 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AMPHP49418 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AMPHP49418 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AMPHP49418 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AMPHP49418 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AMPHP49418 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
AMPHP49418 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AMPHP49418 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AMPHP49418 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AMPHP49418 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AMPHP49418 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AMPHP49418 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AMPHP49418 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AMPHP49418 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AMPHP49418 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AMPHP49418 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
AMPHP49418 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
AMPHP49418 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms