Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms