Protein–RNA interactions for Protein: P48165

GJA8, Gap junction alpha-8 protein, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA8P48165 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJA8P48165 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJA8P48165 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJA8P48165 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GJA8P48165 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GJA8P48165 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJA8P48165 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJA8P48165 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJA8P48165 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJA8P48165 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJA8P48165 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJA8P48165 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJA8P48165 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJA8P48165 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJA8P48165 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJA8P48165 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJA8P48165 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJA8P48165 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJA8P48165 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GJA8P48165 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJA8P48165 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJA8P48165 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJA8P48165 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJA8P48165 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJA8P48165 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJA8P48165 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJA8P48165 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJA8P48165 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJA8P48165 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJA8P48165 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJA8P48165 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJA8P48165 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJA8P48165 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJA8P48165 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJA8P48165 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJA8P48165 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJA8P48165 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJA8P48165 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJA8P48165 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJA8P48165 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GJA8P48165 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJA8P48165 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJA8P48165 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJA8P48165 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJA8P48165 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJA8P48165 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJA8P48165 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJA8P48165 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJA8P48165 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJA8P48165 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJA8P48165 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJA8P48165 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJA8P48165 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJA8P48165 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJA8P48165 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJA8P48165 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJA8P48165 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJA8P48165 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJA8P48165 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJA8P48165 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJA8P48165 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJA8P48165 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJA8P48165 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJA8P48165 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GJA8P48165 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJA8P48165 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJA8P48165 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJA8P48165 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJA8P48165 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJA8P48165 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJA8P48165 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJA8P48165 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJA8P48165 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJA8P48165 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJA8P48165 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJA8P48165 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJA8P48165 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJA8P48165 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJA8P48165 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJA8P48165 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJA8P48165 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJA8P48165 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJA8P48165 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJA8P48165 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJA8P48165 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJA8P48165 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJA8P48165 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJA8P48165 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJA8P48165 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJA8P48165 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJA8P48165 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJA8P48165 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJA8P48165 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GJA8P48165 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJA8P48165 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJA8P48165 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJA8P48165 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJA8P48165 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJA8P48165 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJA8P48165 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms