Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms