Protein–RNA interactions for Protein: P42262

GRIA2, Glutamate receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA2P42262 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIA2P42262 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIA2P42262 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIA2P42262 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIA2P42262 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIA2P42262 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIA2P42262 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIA2P42262 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIA2P42262 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIA2P42262 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIA2P42262 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIA2P42262 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIA2P42262 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIA2P42262 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIA2P42262 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIA2P42262 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIA2P42262 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIA2P42262 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIA2P42262 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIA2P42262 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIA2P42262 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIA2P42262 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIA2P42262 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIA2P42262 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIA2P42262 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIA2P42262 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIA2P42262 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIA2P42262 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIA2P42262 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIA2P42262 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIA2P42262 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIA2P42262 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIA2P42262 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIA2P42262 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIA2P42262 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIA2P42262 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIA2P42262 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIA2P42262 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIA2P42262 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIA2P42262 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIA2P42262 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIA2P42262 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIA2P42262 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIA2P42262 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIA2P42262 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIA2P42262 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIA2P42262 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIA2P42262 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIA2P42262 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIA2P42262 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIA2P42262 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIA2P42262 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIA2P42262 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIA2P42262 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIA2P42262 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIA2P42262 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIA2P42262 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIA2P42262 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIA2P42262 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIA2P42262 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIA2P42262 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIA2P42262 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIA2P42262 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIA2P42262 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIA2P42262 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIA2P42262 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIA2P42262 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIA2P42262 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIA2P42262 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIA2P42262 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIA2P42262 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIA2P42262 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIA2P42262 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIA2P42262 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIA2P42262 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIA2P42262 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIA2P42262 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIA2P42262 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIA2P42262 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIA2P42262 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIA2P42262 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIA2P42262 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIA2P42262 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIA2P42262 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIA2P42262 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIA2P42262 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIA2P42262 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIA2P42262 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIA2P42262 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIA2P42262 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIA2P42262 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIA2P42262 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIA2P42262 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIA2P42262 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIA2P42262 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIA2P42262 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIA2P42262 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIA2P42262 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIA2P42262 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIA2P42262 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms