Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
APOBEC1P41238 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
APOBEC1P41238 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOBEC1P41238 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
APOBEC1P41238 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
APOBEC1P41238 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
APOBEC1P41238 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
APOBEC1P41238 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
APOBEC1P41238 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
APOBEC1P41238 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
APOBEC1P41238 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
APOBEC1P41238 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.08■□□□□ 0
APOBEC1P41238 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
APOBEC1P41238 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOBEC1P41238 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
APOBEC1P41238 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
APOBEC1P41238 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.08■□□□□ 0
APOBEC1P41238 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOBEC1P41238 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOBEC1P41238 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOBEC1P41238 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOBEC1P41238 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
APOBEC1P41238 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOBEC1P41238 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOBEC1P41238 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOBEC1P41238 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOBEC1P41238 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOBEC1P41238 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOBEC1P41238 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.08■□□□□ 0
APOBEC1P41238 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.08■□□□□ 0
APOBEC1P41238 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
APOBEC1P41238 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOBEC1P41238 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
APOBEC1P41238 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
APOBEC1P41238 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOBEC1P41238 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
APOBEC1P41238 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOBEC1P41238 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
APOBEC1P41238 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.07■□□□□ 0
APOBEC1P41238 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOBEC1P41238 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.07■□□□□ 0
APOBEC1P41238 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOBEC1P41238 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOBEC1P41238 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOBEC1P41238 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOBEC1P41238 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
APOBEC1P41238 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
APOBEC1P41238 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.07■□□□□ 0
APOBEC1P41238 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
APOBEC1P41238 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.07■□□□□ 0
APOBEC1P41238 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOBEC1P41238 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.07■□□□□ 0
APOBEC1P41238 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
APOBEC1P41238 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.07■□□□□ 0
APOBEC1P41238 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOBEC1P41238 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
APOBEC1P41238 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOBEC1P41238 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
APOBEC1P41238 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms