Protein–RNA interactions for Protein: P35900

KRT20, Keratin, type I cytoskeletal 20, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT20P35900 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRT20P35900 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRT20P35900 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRT20P35900 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRT20P35900 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRT20P35900 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRT20P35900 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
KRT20P35900 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRT20P35900 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRT20P35900 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRT20P35900 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRT20P35900 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRT20P35900 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRT20P35900 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRT20P35900 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRT20P35900 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
KRT20P35900 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRT20P35900 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRT20P35900 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
KRT20P35900 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
KRT20P35900 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRT20P35900 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRT20P35900 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT20P35900 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT20P35900 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT20P35900 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT20P35900 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT20P35900 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT20P35900 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT20P35900 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT20P35900 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT20P35900 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT20P35900 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT20P35900 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT20P35900 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT20P35900 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT20P35900 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT20P35900 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT20P35900 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT20P35900 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT20P35900 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT20P35900 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT20P35900 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT20P35900 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT20P35900 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT20P35900 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT20P35900 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT20P35900 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT20P35900 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT20P35900 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT20P35900 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT20P35900 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT20P35900 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT20P35900 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT20P35900 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT20P35900 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT20P35900 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT20P35900 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT20P35900 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT20P35900 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT20P35900 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT20P35900 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT20P35900 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT20P35900 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT20P35900 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT20P35900 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT20P35900 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT20P35900 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT20P35900 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT20P35900 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT20P35900 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT20P35900 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT20P35900 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT20P35900 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT20P35900 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT20P35900 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT20P35900 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT20P35900 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT20P35900 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT20P35900 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT20P35900 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT20P35900 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT20P35900 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT20P35900 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT20P35900 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT20P35900 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT20P35900 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT20P35900 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT20P35900 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT20P35900 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT20P35900 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT20P35900 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT20P35900 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT20P35900 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT20P35900 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT20P35900 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT20P35900 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT20P35900 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT20P35900 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT20P35900 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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