Protein–RNA interactions for Protein: P35408

PTGER4, Prostaglandin E2 receptor EP4 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER4P35408 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms