Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CPS1P31327 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CPS1P31327 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CPS1P31327 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CPS1P31327 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CPS1P31327 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CPS1P31327 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CPS1P31327 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CPS1P31327 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CPS1P31327 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CPS1P31327 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CPS1P31327 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CPS1P31327 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CPS1P31327 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CPS1P31327 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CPS1P31327 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CPS1P31327 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CPS1P31327 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CPS1P31327 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CPS1P31327 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CPS1P31327 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CPS1P31327 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CPS1P31327 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CPS1P31327 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CPS1P31327 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CPS1P31327 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CPS1P31327 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CPS1P31327 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CPS1P31327 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CPS1P31327 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CPS1P31327 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CPS1P31327 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CPS1P31327 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CPS1P31327 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CPS1P31327 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CPS1P31327 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CPS1P31327 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CPS1P31327 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CPS1P31327 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CPS1P31327 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CPS1P31327 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CPS1P31327 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CPS1P31327 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CPS1P31327 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CPS1P31327 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CPS1P31327 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CPS1P31327 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CPS1P31327 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CPS1P31327 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CPS1P31327 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CPS1P31327 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CPS1P31327 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CPS1P31327 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CPS1P31327 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CPS1P31327 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CPS1P31327 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CPS1P31327 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CPS1P31327 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CPS1P31327 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CPS1P31327 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CPS1P31327 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CPS1P31327 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CPS1P31327 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CPS1P31327 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CPS1P31327 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CPS1P31327 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CPS1P31327 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CPS1P31327 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CPS1P31327 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CPS1P31327 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CPS1P31327 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CPS1P31327 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CPS1P31327 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CPS1P31327 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CPS1P31327 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CPS1P31327 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CPS1P31327 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CPS1P31327 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CPS1P31327 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CPS1P31327 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CPS1P31327 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CPS1P31327 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CPS1P31327 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CPS1P31327 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CPS1P31327 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CPS1P31327 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CPS1P31327 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CPS1P31327 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CPS1P31327 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CPS1P31327 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CPS1P31327 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CPS1P31327 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CPS1P31327 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CPS1P31327 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CPS1P31327 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CPS1P31327 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CPS1P31327 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CPS1P31327 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CPS1P31327 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CPS1P31327 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms