Protein–RNA interactions for Protein: P31270

HOXA11, Homeobox protein Hox-A11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA11P31270 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXA11P31270 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXA11P31270 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXA11P31270 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXA11P31270 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXA11P31270 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA11P31270 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA11P31270 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA11P31270 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA11P31270 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA11P31270 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA11P31270 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA11P31270 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA11P31270 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA11P31270 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA11P31270 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA11P31270 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA11P31270 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA11P31270 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA11P31270 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA11P31270 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA11P31270 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA11P31270 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA11P31270 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA11P31270 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA11P31270 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA11P31270 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA11P31270 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA11P31270 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA11P31270 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA11P31270 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA11P31270 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA11P31270 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA11P31270 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA11P31270 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA11P31270 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA11P31270 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA11P31270 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA11P31270 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA11P31270 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA11P31270 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA11P31270 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
HOXA11P31270 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA11P31270 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA11P31270 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA11P31270 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA11P31270 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA11P31270 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA11P31270 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA11P31270 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA11P31270 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA11P31270 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA11P31270 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA11P31270 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA11P31270 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA11P31270 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA11P31270 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA11P31270 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA11P31270 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA11P31270 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA11P31270 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA11P31270 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA11P31270 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA11P31270 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA11P31270 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA11P31270 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA11P31270 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA11P31270 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA11P31270 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA11P31270 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA11P31270 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA11P31270 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA11P31270 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA11P31270 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA11P31270 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA11P31270 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA11P31270 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA11P31270 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA11P31270 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA11P31270 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA11P31270 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA11P31270 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA11P31270 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA11P31270 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA11P31270 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA11P31270 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA11P31270 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA11P31270 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA11P31270 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA11P31270 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA11P31270 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA11P31270 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA11P31270 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA11P31270 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA11P31270 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA11P31270 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA11P31270 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA11P31270 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA11P31270 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA11P31270 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms