Protein–RNA interactions for Protein: P31260

HOXA10, Homeobox protein Hox-A10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA10P31260 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms