Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TSPOP30536 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TSPOP30536 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
TSPOP30536 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TSPOP30536 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TSPOP30536 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TSPOP30536 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
TSPOP30536 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TSPOP30536 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TSPOP30536 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TSPOP30536 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TSPOP30536 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TSPOP30536 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TSPOP30536 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TSPOP30536 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TSPOP30536 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TSPOP30536 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TSPOP30536 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TSPOP30536 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TSPOP30536 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TSPOP30536 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TSPOP30536 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TSPOP30536 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TSPOP30536 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TSPOP30536 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TSPOP30536 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TSPOP30536 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
TSPOP30536 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TSPOP30536 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TSPOP30536 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TSPOP30536 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TSPOP30536 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TSPOP30536 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TSPOP30536 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TSPOP30536 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TSPOP30536 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
TSPOP30536 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TSPOP30536 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TSPOP30536 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TSPOP30536 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TSPOP30536 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TSPOP30536 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TSPOP30536 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TSPOP30536 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TSPOP30536 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TSPOP30536 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TSPOP30536 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
TSPOP30536 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TSPOP30536 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TSPOP30536 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TSPOP30536 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TSPOP30536 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TSPOP30536 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TSPOP30536 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TSPOP30536 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TSPOP30536 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TSPOP30536 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
TSPOP30536 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TSPOP30536 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TSPOP30536 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TSPOP30536 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
TSPOP30536 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TSPOP30536 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TSPOP30536 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TSPOP30536 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TSPOP30536 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TSPOP30536 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TSPOP30536 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TSPOP30536 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TSPOP30536 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TSPOP30536 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TSPOP30536 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TSPOP30536 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TSPOP30536 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TSPOP30536 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TSPOP30536 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TSPOP30536 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TSPOP30536 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TSPOP30536 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
TSPOP30536 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TSPOP30536 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TSPOP30536 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TSPOP30536 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TSPOP30536 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TSPOP30536 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TSPOP30536 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TSPOP30536 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TSPOP30536 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TSPOP30536 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TSPOP30536 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TSPOP30536 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TSPOP30536 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TSPOP30536 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TSPOP30536 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TSPOP30536 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TSPOP30536 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TSPOP30536 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TSPOP30536 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TSPOP30536 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TSPOP30536 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.1 ms