Protein–RNA interactions for Protein: P30085

CMPK1, UMP-CMP kinase, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK1P30085 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMPK1P30085 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms