Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CNGA1P29973 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CNGA1P29973 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CNGA1P29973 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CNGA1P29973 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CNGA1P29973 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNGA1P29973 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNGA1P29973 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNGA1P29973 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNGA1P29973 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNGA1P29973 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNGA1P29973 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNGA1P29973 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CNGA1P29973 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNGA1P29973 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNGA1P29973 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNGA1P29973 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNGA1P29973 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNGA1P29973 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNGA1P29973 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNGA1P29973 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNGA1P29973 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CNGA1P29973 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNGA1P29973 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNGA1P29973 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNGA1P29973 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNGA1P29973 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNGA1P29973 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNGA1P29973 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CNGA1P29973 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNGA1P29973 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNGA1P29973 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNGA1P29973 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNGA1P29973 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNGA1P29973 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNGA1P29973 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNGA1P29973 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNGA1P29973 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNGA1P29973 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CNGA1P29973 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CNGA1P29973 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CNGA1P29973 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CNGA1P29973 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CNGA1P29973 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CNGA1P29973 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CNGA1P29973 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CNGA1P29973 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CNGA1P29973 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CNGA1P29973 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CNGA1P29973 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CNGA1P29973 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CNGA1P29973 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CNGA1P29973 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CNGA1P29973 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CNGA1P29973 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CNGA1P29973 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CNGA1P29973 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CNGA1P29973 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CNGA1P29973 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CNGA1P29973 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CNGA1P29973 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CNGA1P29973 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CNGA1P29973 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CNGA1P29973 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CNGA1P29973 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CNGA1P29973 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CNGA1P29973 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CNGA1P29973 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CNGA1P29973 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CNGA1P29973 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CNGA1P29973 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CNGA1P29973 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CNGA1P29973 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CNGA1P29973 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CNGA1P29973 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CNGA1P29973 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CNGA1P29973 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CNGA1P29973 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CNGA1P29973 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CNGA1P29973 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CNGA1P29973 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CNGA1P29973 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CNGA1P29973 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CNGA1P29973 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CNGA1P29973 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CNGA1P29973 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CNGA1P29973 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CNGA1P29973 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CNGA1P29973 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CNGA1P29973 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CNGA1P29973 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CNGA1P29973 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CNGA1P29973 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CNGA1P29973 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CNGA1P29973 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CNGA1P29973 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CNGA1P29973 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CNGA1P29973 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CNGA1P29973 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CNGA1P29973 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms