Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms