Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DNMT1P26358 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
DNMT1P26358 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
DNMT1P26358 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
DNMT1P26358 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DNMT1P26358 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DNMT1P26358 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
DNMT1P26358 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
DNMT1P26358 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
DNMT1P26358 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
DNMT1P26358 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
DNMT1P26358 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
DNMT1P26358 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
DNMT1P26358 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DNMT1P26358 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DNMT1P26358 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DNMT1P26358 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DNMT1P26358 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DNMT1P26358 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DNMT1P26358 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DNMT1P26358 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DNMT1P26358 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DNMT1P26358 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
DNMT1P26358 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DNMT1P26358 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DNMT1P26358 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DNMT1P26358 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DNMT1P26358 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DNMT1P26358 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DNMT1P26358 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DNMT1P26358 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DNMT1P26358 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DNMT1P26358 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DNMT1P26358 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DNMT1P26358 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DNMT1P26358 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
DNMT1P26358 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DNMT1P26358 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DNMT1P26358 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DNMT1P26358 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DNMT1P26358 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DNMT1P26358 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DNMT1P26358 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DNMT1P26358 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DNMT1P26358 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DNMT1P26358 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DNMT1P26358 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DNMT1P26358 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DNMT1P26358 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DNMT1P26358 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DNMT1P26358 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DNMT1P26358 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DNMT1P26358 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DNMT1P26358 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DNMT1P26358 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DNMT1P26358 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DNMT1P26358 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DNMT1P26358 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DNMT1P26358 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DNMT1P26358 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DNMT1P26358 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DNMT1P26358 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DNMT1P26358 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DNMT1P26358 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DNMT1P26358 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DNMT1P26358 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DNMT1P26358 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DNMT1P26358 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DNMT1P26358 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DNMT1P26358 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DNMT1P26358 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
DNMT1P26358 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DNMT1P26358 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DNMT1P26358 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DNMT1P26358 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
DNMT1P26358 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DNMT1P26358 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DNMT1P26358 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DNMT1P26358 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DNMT1P26358 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DNMT1P26358 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DNMT1P26358 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DNMT1P26358 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DNMT1P26358 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DNMT1P26358 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DNMT1P26358 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
DNMT1P26358 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DNMT1P26358 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DNMT1P26358 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DNMT1P26358 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DNMT1P26358 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DNMT1P26358 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
DNMT1P26358 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DNMT1P26358 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DNMT1P26358 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DNMT1P26358 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DNMT1P26358 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DNMT1P26358 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DNMT1P26358 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DNMT1P26358 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms