Protein–RNA interactions for Protein: P25391

LAMA1, Laminin subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 3,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA1P25391 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LAMA1P25391 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LAMA1P25391 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LAMA1P25391 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LAMA1P25391 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LAMA1P25391 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LAMA1P25391 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LAMA1P25391 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LAMA1P25391 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LAMA1P25391 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LAMA1P25391 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LAMA1P25391 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LAMA1P25391 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LAMA1P25391 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LAMA1P25391 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LAMA1P25391 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LAMA1P25391 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LAMA1P25391 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LAMA1P25391 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LAMA1P25391 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LAMA1P25391 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LAMA1P25391 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LAMA1P25391 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LAMA1P25391 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LAMA1P25391 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LAMA1P25391 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LAMA1P25391 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms