Protein–RNA interactions for Protein: P24347

MMP11, Stromelysin-3, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP11P24347 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MMP11P24347 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MMP11P24347 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MMP11P24347 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MMP11P24347 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MMP11P24347 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MMP11P24347 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MMP11P24347 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MMP11P24347 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MMP11P24347 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MMP11P24347 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MMP11P24347 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MMP11P24347 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MMP11P24347 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MMP11P24347 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MMP11P24347 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MMP11P24347 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MMP11P24347 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MMP11P24347 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MMP11P24347 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MMP11P24347 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MMP11P24347 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
MMP11P24347 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MMP11P24347 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MMP11P24347 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MMP11P24347 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MMP11P24347 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MMP11P24347 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MMP11P24347 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MMP11P24347 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MMP11P24347 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MMP11P24347 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MMP11P24347 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
MMP11P24347 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MMP11P24347 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MMP11P24347 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MMP11P24347 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MMP11P24347 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MMP11P24347 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MMP11P24347 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MMP11P24347 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MMP11P24347 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MMP11P24347 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MMP11P24347 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MMP11P24347 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MMP11P24347 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MMP11P24347 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MMP11P24347 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
MMP11P24347 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MMP11P24347 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MMP11P24347 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MMP11P24347 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MMP11P24347 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MMP11P24347 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MMP11P24347 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MMP11P24347 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MMP11P24347 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MMP11P24347 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MMP11P24347 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MMP11P24347 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MMP11P24347 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MMP11P24347 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
MMP11P24347 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MMP11P24347 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MMP11P24347 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MMP11P24347 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MMP11P24347 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MMP11P24347 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MMP11P24347 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
MMP11P24347 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
MMP11P24347 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MMP11P24347 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MMP11P24347 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MMP11P24347 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MMP11P24347 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MMP11P24347 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MMP11P24347 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MMP11P24347 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MMP11P24347 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
MMP11P24347 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MMP11P24347 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MMP11P24347 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MMP11P24347 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MMP11P24347 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MMP11P24347 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MMP11P24347 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MMP11P24347 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MMP11P24347 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MMP11P24347 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MMP11P24347 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MMP11P24347 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MMP11P24347 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MMP11P24347 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MMP11P24347 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MMP11P24347 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MMP11P24347 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MMP11P24347 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MMP11P24347 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MMP11P24347 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MMP11P24347 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms