Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD247P20963 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD247P20963 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD247P20963 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD247P20963 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD247P20963 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD247P20963 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD247P20963 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD247P20963 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD247P20963 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD247P20963 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD247P20963 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD247P20963 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD247P20963 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD247P20963 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD247P20963 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD247P20963 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD247P20963 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD247P20963 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD247P20963 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD247P20963 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD247P20963 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD247P20963 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD247P20963 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD247P20963 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD247P20963 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD247P20963 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD247P20963 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CD247P20963 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD247P20963 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD247P20963 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD247P20963 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD247P20963 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD247P20963 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD247P20963 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD247P20963 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD247P20963 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD247P20963 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD247P20963 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD247P20963 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD247P20963 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD247P20963 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD247P20963 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD247P20963 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD247P20963 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD247P20963 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD247P20963 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CD247P20963 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD247P20963 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD247P20963 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD247P20963 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD247P20963 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD247P20963 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD247P20963 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD247P20963 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD247P20963 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD247P20963 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD247P20963 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD247P20963 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD247P20963 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD247P20963 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD247P20963 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD247P20963 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD247P20963 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD247P20963 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD247P20963 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD247P20963 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD247P20963 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD247P20963 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD247P20963 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD247P20963 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD247P20963 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CD247P20963 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD247P20963 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD247P20963 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD247P20963 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD247P20963 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD247P20963 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD247P20963 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD247P20963 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD247P20963 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD247P20963 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD247P20963 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CD247P20963 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CD247P20963 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD247P20963 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD247P20963 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD247P20963 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD247P20963 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CD247P20963 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD247P20963 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD247P20963 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CD247P20963 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD247P20963 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD247P20963 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CD247P20963 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CD247P20963 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD247P20963 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD247P20963 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD247P20963 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms