Protein–RNA interactions for Protein: P20719

HOXA5, Homeobox protein Hox-A5, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA5P20719 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms