Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXB3P14651 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXB3P14651 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXB3P14651 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXB3P14651 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXB3P14651 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXB3P14651 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
HOXB3P14651 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
HOXB3P14651 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 APOH-201ENST00000205948 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 RAB30-AS1-205ENST00000530270 1116 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 AC004777.1-201ENST00000624317 287 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 AC087273.1-201ENST00000519368 529 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 AC020892.1-201ENST00000559918 855 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 AC093783.1-201ENST00000612976 329 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms