Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms