Protein–RNA interactions for Protein: P13500

CCL2, C-C motif chemokine 2, humanhuman

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL2P13500 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL2P13500 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL2P13500 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL2P13500 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL2P13500 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL2P13500 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL2P13500 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL2P13500 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL2P13500 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL2P13500 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL2P13500 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL2P13500 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL2P13500 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL2P13500 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL2P13500 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL2P13500 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL2P13500 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL2P13500 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL2P13500 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL2P13500 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL2P13500 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL2P13500 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL2P13500 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL2P13500 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL2P13500 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL2P13500 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCL2P13500 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCL2P13500 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCL2P13500 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCL2P13500 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCL2P13500 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCL2P13500 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCL2P13500 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCL2P13500 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCL2P13500 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCL2P13500 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCL2P13500 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CCL2P13500 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCL2P13500 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCL2P13500 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCL2P13500 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCL2P13500 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCL2P13500 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCL2P13500 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCL2P13500 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCL2P13500 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCL2P13500 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCL2P13500 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCL2P13500 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCL2P13500 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCL2P13500 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCL2P13500 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CCL2P13500 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCL2P13500 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCL2P13500 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCL2P13500 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCL2P13500 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCL2P13500 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCL2P13500 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCL2P13500 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CCL2P13500 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCL2P13500 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCL2P13500 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCL2P13500 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCL2P13500 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCL2P13500 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCL2P13500 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCL2P13500 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCL2P13500 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCL2P13500 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCL2P13500 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCL2P13500 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCL2P13500 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCL2P13500 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CCL2P13500 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCL2P13500 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCL2P13500 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCL2P13500 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCL2P13500 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCL2P13500 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCL2P13500 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCL2P13500 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCL2P13500 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CCL2P13500 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCL2P13500 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCL2P13500 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCL2P13500 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCL2P13500 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCL2P13500 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCL2P13500 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCL2P13500 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CCL2P13500 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCL2P13500 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CCL2P13500 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCL2P13500 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCL2P13500 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CCL2P13500 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCL2P13500 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCL2P13500 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCL2P13500 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
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