Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
ACTN1P12814 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACTN1P12814 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACTN1P12814 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACTN1P12814 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACTN1P12814 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACTN1P12814 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACTN1P12814 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACTN1P12814 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACTN1P12814 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACTN1P12814 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACTN1P12814 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACTN1P12814 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACTN1P12814 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACTN1P12814 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACTN1P12814 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACTN1P12814 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACTN1P12814 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ACTN1P12814 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACTN1P12814 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ACTN1P12814 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACTN1P12814 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACTN1P12814 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ACTN1P12814 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ACTN1P12814 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACTN1P12814 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACTN1P12814 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACTN1P12814 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACTN1P12814 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ACTN1P12814 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACTN1P12814 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACTN1P12814 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACTN1P12814 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACTN1P12814 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACTN1P12814 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACTN1P12814 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACTN1P12814 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACTN1P12814 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ACTN1P12814 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACTN1P12814 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ACTN1P12814 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACTN1P12814 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms