Protein–RNA interactions for Protein: P10826

RARB, Retinoic acid receptor beta, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARBP10826 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RARBP10826 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RARBP10826 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RARBP10826 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RARBP10826 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RARBP10826 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RARBP10826 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RARBP10826 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RARBP10826 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RARBP10826 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RARBP10826 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RARBP10826 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RARBP10826 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RARBP10826 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RARBP10826 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RARBP10826 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RARBP10826 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RARBP10826 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RARBP10826 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RARBP10826 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RARBP10826 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RARBP10826 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RARBP10826 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RARBP10826 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RARBP10826 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RARBP10826 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RARBP10826 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RARBP10826 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RARBP10826 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RARBP10826 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RARBP10826 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RARBP10826 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RARBP10826 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
RARBP10826 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RARBP10826 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RARBP10826 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RARBP10826 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RARBP10826 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RARBP10826 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RARBP10826 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RARBP10826 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RARBP10826 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RARBP10826 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RARBP10826 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RARBP10826 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RARBP10826 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RARBP10826 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
RARBP10826 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RARBP10826 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RARBP10826 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RARBP10826 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RARBP10826 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RARBP10826 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RARBP10826 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RARBP10826 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RARBP10826 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RARBP10826 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RARBP10826 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RARBP10826 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RARBP10826 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RARBP10826 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RARBP10826 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RARBP10826 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RARBP10826 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RARBP10826 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RARBP10826 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RARBP10826 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RARBP10826 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RARBP10826 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RARBP10826 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RARBP10826 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RARBP10826 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RARBP10826 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RARBP10826 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RARBP10826 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RARBP10826 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RARBP10826 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RARBP10826 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RARBP10826 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RARBP10826 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RARBP10826 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RARBP10826 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
RARBP10826 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RARBP10826 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
RARBP10826 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
RARBP10826 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RARBP10826 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RARBP10826 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RARBP10826 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RARBP10826 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RARBP10826 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RARBP10826 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RARBP10826 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RARBP10826 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RARBP10826 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
RARBP10826 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RARBP10826 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RARBP10826 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RARBP10826 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RARBP10826 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms