Protein–RNA interactions for Protein: P10070

GLI2, Zinc finger protein GLI2, humanhuman

Predictions only

Length 1,586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI2P10070 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GLI2P10070 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GLI2P10070 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GLI2P10070 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GLI2P10070 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GLI2P10070 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GLI2P10070 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GLI2P10070 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GLI2P10070 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GLI2P10070 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GLI2P10070 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
GLI2P10070 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GLI2P10070 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GLI2P10070 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GLI2P10070 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GLI2P10070 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GLI2P10070 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GLI2P10070 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GLI2P10070 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GLI2P10070 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GLI2P10070 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GLI2P10070 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GLI2P10070 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GLI2P10070 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GLI2P10070 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GLI2P10070 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
GLI2P10070 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GLI2P10070 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GLI2P10070 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
GLI2P10070 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GLI2P10070 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GLI2P10070 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GLI2P10070 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GLI2P10070 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GLI2P10070 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
GLI2P10070 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GLI2P10070 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GLI2P10070 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GLI2P10070 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GLI2P10070 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GLI2P10070 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GLI2P10070 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GLI2P10070 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GLI2P10070 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GLI2P10070 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GLI2P10070 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GLI2P10070 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GLI2P10070 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GLI2P10070 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GLI2P10070 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GLI2P10070 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GLI2P10070 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
GLI2P10070 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GLI2P10070 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GLI2P10070 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GLI2P10070 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GLI2P10070 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
GLI2P10070 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GLI2P10070 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
GLI2P10070 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GLI2P10070 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GLI2P10070 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GLI2P10070 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GLI2P10070 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GLI2P10070 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GLI2P10070 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GLI2P10070 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GLI2P10070 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GLI2P10070 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GLI2P10070 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GLI2P10070 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GLI2P10070 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GLI2P10070 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GLI2P10070 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GLI2P10070 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GLI2P10070 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GLI2P10070 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GLI2P10070 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GLI2P10070 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GLI2P10070 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GLI2P10070 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GLI2P10070 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GLI2P10070 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GLI2P10070 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GLI2P10070 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GLI2P10070 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GLI2P10070 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
GLI2P10070 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GLI2P10070 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GLI2P10070 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GLI2P10070 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GLI2P10070 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GLI2P10070 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GLI2P10070 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
GLI2P10070 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GLI2P10070 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GLI2P10070 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GLI2P10070 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GLI2P10070 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GLI2P10070 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms