Protein–RNA interactions for Protein: P0DN79

CBSL, Cystathionine beta-synthase-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBSLP0DN79 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CBSLP0DN79 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CBSLP0DN79 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CBSLP0DN79 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CBSLP0DN79 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CBSLP0DN79 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CBSLP0DN79 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CBSLP0DN79 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CBSLP0DN79 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CBSLP0DN79 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CBSLP0DN79 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CBSLP0DN79 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CBSLP0DN79 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CBSLP0DN79 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CBSLP0DN79 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CBSLP0DN79 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CBSLP0DN79 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CBSLP0DN79 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CBSLP0DN79 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CBSLP0DN79 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CBSLP0DN79 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CBSLP0DN79 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CBSLP0DN79 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CBSLP0DN79 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CBSLP0DN79 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CBSLP0DN79 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CBSLP0DN79 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CBSLP0DN79 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CBSLP0DN79 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CBSLP0DN79 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CBSLP0DN79 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CBSLP0DN79 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CBSLP0DN79 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CBSLP0DN79 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CBSLP0DN79 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CBSLP0DN79 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CBSLP0DN79 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CBSLP0DN79 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CBSLP0DN79 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CBSLP0DN79 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CBSLP0DN79 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CBSLP0DN79 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CBSLP0DN79 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CBSLP0DN79 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CBSLP0DN79 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CBSLP0DN79 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CBSLP0DN79 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CBSLP0DN79 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CBSLP0DN79 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CBSLP0DN79 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CBSLP0DN79 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CBSLP0DN79 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
CBSLP0DN79 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CBSLP0DN79 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CBSLP0DN79 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CBSLP0DN79 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CBSLP0DN79 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CBSLP0DN79 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CBSLP0DN79 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CBSLP0DN79 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CBSLP0DN79 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CBSLP0DN79 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CBSLP0DN79 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CBSLP0DN79 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CBSLP0DN79 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CBSLP0DN79 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CBSLP0DN79 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CBSLP0DN79 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CBSLP0DN79 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CBSLP0DN79 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CBSLP0DN79 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CBSLP0DN79 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CBSLP0DN79 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CBSLP0DN79 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CBSLP0DN79 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CBSLP0DN79 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CBSLP0DN79 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CBSLP0DN79 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CBSLP0DN79 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CBSLP0DN79 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CBSLP0DN79 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CBSLP0DN79 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CBSLP0DN79 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CBSLP0DN79 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CBSLP0DN79 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CBSLP0DN79 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CBSLP0DN79 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CBSLP0DN79 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CBSLP0DN79 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CBSLP0DN79 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CBSLP0DN79 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CBSLP0DN79 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CBSLP0DN79 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CBSLP0DN79 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CBSLP0DN79 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CBSLP0DN79 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CBSLP0DN79 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CBSLP0DN79 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CBSLP0DN79 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CBSLP0DN79 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms