Protein–RNA interactions for Protein: O95819

MAP4K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP4K4O95819 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MAP4K4O95819 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MAP4K4O95819 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MAP4K4O95819 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MAP4K4O95819 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MAP4K4O95819 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MAP4K4O95819 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MAP4K4O95819 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
MAP4K4O95819 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MAP4K4O95819 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MAP4K4O95819 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MAP4K4O95819 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MAP4K4O95819 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MAP4K4O95819 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MAP4K4O95819 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MAP4K4O95819 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MAP4K4O95819 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MAP4K4O95819 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MAP4K4O95819 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MAP4K4O95819 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MAP4K4O95819 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MAP4K4O95819 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MAP4K4O95819 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MAP4K4O95819 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MAP4K4O95819 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
MAP4K4O95819 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MAP4K4O95819 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MAP4K4O95819 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MAP4K4O95819 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MAP4K4O95819 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MAP4K4O95819 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MAP4K4O95819 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MAP4K4O95819 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MAP4K4O95819 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MAP4K4O95819 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MAP4K4O95819 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
MAP4K4O95819 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MAP4K4O95819 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MAP4K4O95819 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MAP4K4O95819 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
MAP4K4O95819 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MAP4K4O95819 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
MAP4K4O95819 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MAP4K4O95819 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
MAP4K4O95819 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MAP4K4O95819 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MAP4K4O95819 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MAP4K4O95819 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MAP4K4O95819 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MAP4K4O95819 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MAP4K4O95819 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MAP4K4O95819 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MAP4K4O95819 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MAP4K4O95819 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MAP4K4O95819 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MAP4K4O95819 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MAP4K4O95819 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MAP4K4O95819 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MAP4K4O95819 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MAP4K4O95819 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MAP4K4O95819 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MAP4K4O95819 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MAP4K4O95819 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MAP4K4O95819 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MAP4K4O95819 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MAP4K4O95819 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MAP4K4O95819 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
MAP4K4O95819 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MAP4K4O95819 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MAP4K4O95819 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MAP4K4O95819 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MAP4K4O95819 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MAP4K4O95819 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MAP4K4O95819 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MAP4K4O95819 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
MAP4K4O95819 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MAP4K4O95819 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
MAP4K4O95819 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MAP4K4O95819 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MAP4K4O95819 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MAP4K4O95819 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MAP4K4O95819 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MAP4K4O95819 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MAP4K4O95819 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MAP4K4O95819 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
MAP4K4O95819 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MAP4K4O95819 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MAP4K4O95819 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MAP4K4O95819 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MAP4K4O95819 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MAP4K4O95819 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MAP4K4O95819 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MAP4K4O95819 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MAP4K4O95819 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MAP4K4O95819 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MAP4K4O95819 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MAP4K4O95819 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MAP4K4O95819 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MAP4K4O95819 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MAP4K4O95819 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms