Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
E2F6O75461 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
E2F6O75461 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
E2F6O75461 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
E2F6O75461 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
E2F6O75461 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
E2F6O75461 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
E2F6O75461 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
E2F6O75461 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
E2F6O75461 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
E2F6O75461 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
E2F6O75461 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
E2F6O75461 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
E2F6O75461 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
E2F6O75461 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
E2F6O75461 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
E2F6O75461 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
E2F6O75461 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
E2F6O75461 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
E2F6O75461 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
E2F6O75461 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
E2F6O75461 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
E2F6O75461 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
E2F6O75461 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
E2F6O75461 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
E2F6O75461 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
E2F6O75461 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
E2F6O75461 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
E2F6O75461 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
E2F6O75461 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
E2F6O75461 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
E2F6O75461 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
E2F6O75461 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
E2F6O75461 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
E2F6O75461 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
E2F6O75461 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
E2F6O75461 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
E2F6O75461 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
E2F6O75461 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
E2F6O75461 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
E2F6O75461 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
E2F6O75461 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
E2F6O75461 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
E2F6O75461 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
E2F6O75461 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
E2F6O75461 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
E2F6O75461 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F6O75461 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F6O75461 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F6O75461 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F6O75461 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F6O75461 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F6O75461 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F6O75461 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F6O75461 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F6O75461 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F6O75461 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F6O75461 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F6O75461 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F6O75461 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F6O75461 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F6O75461 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F6O75461 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F6O75461 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F6O75461 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F6O75461 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F6O75461 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F6O75461 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F6O75461 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F6O75461 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F6O75461 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F6O75461 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F6O75461 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F6O75461 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F6O75461 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F6O75461 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F6O75461 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F6O75461 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F6O75461 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F6O75461 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F6O75461 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F6O75461 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F6O75461 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F6O75461 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F6O75461 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F6O75461 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F6O75461 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F6O75461 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F6O75461 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F6O75461 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F6O75461 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F6O75461 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F6O75461 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F6O75461 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F6O75461 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F6O75461 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F6O75461 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F6O75461 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F6O75461 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F6O75461 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms