Protein–RNA interactions for Protein: O60931

CTNS, Cystinosin, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNSO60931 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTNSO60931 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTNSO60931 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTNSO60931 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTNSO60931 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTNSO60931 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTNSO60931 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTNSO60931 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTNSO60931 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTNSO60931 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTNSO60931 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CTNSO60931 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTNSO60931 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CTNSO60931 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTNSO60931 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTNSO60931 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTNSO60931 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CTNSO60931 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTNSO60931 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTNSO60931 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTNSO60931 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTNSO60931 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTNSO60931 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTNSO60931 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTNSO60931 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTNSO60931 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTNSO60931 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTNSO60931 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTNSO60931 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTNSO60931 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTNSO60931 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTNSO60931 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTNSO60931 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTNSO60931 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTNSO60931 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTNSO60931 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTNSO60931 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CTNSO60931 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTNSO60931 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTNSO60931 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTNSO60931 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTNSO60931 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTNSO60931 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTNSO60931 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTNSO60931 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTNSO60931 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTNSO60931 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTNSO60931 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTNSO60931 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTNSO60931 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CTNSO60931 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTNSO60931 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTNSO60931 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTNSO60931 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTNSO60931 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTNSO60931 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CTNSO60931 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTNSO60931 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTNSO60931 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTNSO60931 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTNSO60931 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTNSO60931 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTNSO60931 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTNSO60931 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTNSO60931 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTNSO60931 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTNSO60931 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTNSO60931 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTNSO60931 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTNSO60931 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTNSO60931 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNSO60931 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNSO60931 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNSO60931 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNSO60931 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNSO60931 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNSO60931 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNSO60931 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNSO60931 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNSO60931 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNSO60931 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNSO60931 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNSO60931 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNSO60931 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNSO60931 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNSO60931 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNSO60931 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNSO60931 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNSO60931 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNSO60931 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNSO60931 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNSO60931 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNSO60931 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNSO60931 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNSO60931 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNSO60931 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNSO60931 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNSO60931 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNSO60931 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNSO60931 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms