Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPLO60437 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPLO60437 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPLO60437 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPLO60437 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPLO60437 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPLO60437 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PPLO60437 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PPLO60437 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPLO60437 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPLO60437 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPLO60437 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPLO60437 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPLO60437 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPLO60437 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPLO60437 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPLO60437 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPLO60437 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPLO60437 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPLO60437 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPLO60437 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPLO60437 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPLO60437 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPLO60437 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPLO60437 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPLO60437 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPLO60437 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPLO60437 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPLO60437 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPLO60437 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPLO60437 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPLO60437 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPLO60437 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPLO60437 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPLO60437 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPLO60437 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPLO60437 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPLO60437 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPLO60437 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPLO60437 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPLO60437 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PPLO60437 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPLO60437 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPLO60437 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PPLO60437 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PPLO60437 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PPLO60437 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPLO60437 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPLO60437 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPLO60437 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPLO60437 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPLO60437 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPLO60437 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPLO60437 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPLO60437 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPLO60437 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PPLO60437 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPLO60437 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPLO60437 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PPLO60437 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPLO60437 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPLO60437 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPLO60437 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPLO60437 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPLO60437 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPLO60437 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPLO60437 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPLO60437 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPLO60437 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPLO60437 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPLO60437 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PPLO60437 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PPLO60437 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PPLO60437 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PPLO60437 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
PPLO60437 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PPLO60437 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PPLO60437 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PPLO60437 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PPLO60437 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPLO60437 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPLO60437 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPLO60437 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPLO60437 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPLO60437 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPLO60437 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPLO60437 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PPLO60437 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPLO60437 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PPLO60437 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPLO60437 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPLO60437 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPLO60437 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPLO60437 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPLO60437 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPLO60437 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPLO60437 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPLO60437 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPLO60437 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPLO60437 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms