Protein–RNA interactions for Protein: O60271

SPAG9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG9O60271 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPAG9O60271 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPAG9O60271 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPAG9O60271 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPAG9O60271 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPAG9O60271 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPAG9O60271 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPAG9O60271 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPAG9O60271 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPAG9O60271 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SPAG9O60271 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPAG9O60271 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPAG9O60271 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPAG9O60271 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SPAG9O60271 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPAG9O60271 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPAG9O60271 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPAG9O60271 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPAG9O60271 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPAG9O60271 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPAG9O60271 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPAG9O60271 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPAG9O60271 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPAG9O60271 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SPAG9O60271 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPAG9O60271 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPAG9O60271 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPAG9O60271 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPAG9O60271 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPAG9O60271 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPAG9O60271 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPAG9O60271 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPAG9O60271 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPAG9O60271 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPAG9O60271 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPAG9O60271 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPAG9O60271 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPAG9O60271 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPAG9O60271 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SPAG9O60271 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SPAG9O60271 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPAG9O60271 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPAG9O60271 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPAG9O60271 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPAG9O60271 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPAG9O60271 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPAG9O60271 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPAG9O60271 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPAG9O60271 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPAG9O60271 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPAG9O60271 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPAG9O60271 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SPAG9O60271 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SPAG9O60271 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPAG9O60271 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SPAG9O60271 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SPAG9O60271 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPAG9O60271 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPAG9O60271 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPAG9O60271 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPAG9O60271 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPAG9O60271 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPAG9O60271 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPAG9O60271 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPAG9O60271 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPAG9O60271 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPAG9O60271 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPAG9O60271 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPAG9O60271 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPAG9O60271 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPAG9O60271 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPAG9O60271 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPAG9O60271 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPAG9O60271 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPAG9O60271 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPAG9O60271 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPAG9O60271 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPAG9O60271 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPAG9O60271 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SPAG9O60271 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SPAG9O60271 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SPAG9O60271 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPAG9O60271 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPAG9O60271 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPAG9O60271 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPAG9O60271 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPAG9O60271 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPAG9O60271 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPAG9O60271 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPAG9O60271 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPAG9O60271 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SPAG9O60271 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPAG9O60271 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPAG9O60271 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPAG9O60271 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPAG9O60271 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPAG9O60271 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPAG9O60271 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPAG9O60271 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SPAG9O60271 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms