Protein–RNA interactions for Protein: O43405

COCH, Cochlin, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCHO43405 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COCHO43405 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COCHO43405 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COCHO43405 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
COCHO43405 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COCHO43405 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COCHO43405 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COCHO43405 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COCHO43405 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COCHO43405 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COCHO43405 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COCHO43405 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COCHO43405 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COCHO43405 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COCHO43405 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COCHO43405 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COCHO43405 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COCHO43405 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COCHO43405 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COCHO43405 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COCHO43405 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
COCHO43405 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COCHO43405 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COCHO43405 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COCHO43405 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COCHO43405 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COCHO43405 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COCHO43405 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COCHO43405 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COCHO43405 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
COCHO43405 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
COCHO43405 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COCHO43405 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COCHO43405 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COCHO43405 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COCHO43405 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COCHO43405 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COCHO43405 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COCHO43405 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COCHO43405 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COCHO43405 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COCHO43405 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COCHO43405 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COCHO43405 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COCHO43405 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COCHO43405 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
COCHO43405 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COCHO43405 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COCHO43405 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COCHO43405 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COCHO43405 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COCHO43405 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COCHO43405 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COCHO43405 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COCHO43405 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COCHO43405 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COCHO43405 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COCHO43405 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COCHO43405 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COCHO43405 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
COCHO43405 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
COCHO43405 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COCHO43405 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COCHO43405 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COCHO43405 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COCHO43405 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
COCHO43405 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COCHO43405 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COCHO43405 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
COCHO43405 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COCHO43405 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COCHO43405 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COCHO43405 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
COCHO43405 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
COCHO43405 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
COCHO43405 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
COCHO43405 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
COCHO43405 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COCHO43405 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COCHO43405 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COCHO43405 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COCHO43405 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COCHO43405 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COCHO43405 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COCHO43405 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COCHO43405 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COCHO43405 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COCHO43405 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COCHO43405 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COCHO43405 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COCHO43405 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
COCHO43405 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COCHO43405 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COCHO43405 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
COCHO43405 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COCHO43405 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
COCHO43405 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
COCHO43405 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COCHO43405 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COCHO43405 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms