Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBDO15205 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBDO15205 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBDO15205 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBDO15205 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBDO15205 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBDO15205 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBDO15205 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBDO15205 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
UBDO15205 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
UBDO15205 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBDO15205 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBDO15205 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBDO15205 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBDO15205 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBDO15205 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
UBDO15205 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBDO15205 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBDO15205 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBDO15205 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBDO15205 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBDO15205 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBDO15205 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBDO15205 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBDO15205 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBDO15205 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBDO15205 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBDO15205 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
UBDO15205 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBDO15205 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBDO15205 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
UBDO15205 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBDO15205 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBDO15205 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBDO15205 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBDO15205 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBDO15205 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBDO15205 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBDO15205 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBDO15205 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBDO15205 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBDO15205 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBDO15205 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBDO15205 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBDO15205 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
UBDO15205 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBDO15205 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBDO15205 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBDO15205 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBDO15205 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBDO15205 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBDO15205 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBDO15205 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBDO15205 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBDO15205 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBDO15205 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBDO15205 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBDO15205 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBDO15205 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBDO15205 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBDO15205 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBDO15205 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBDO15205 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBDO15205 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBDO15205 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBDO15205 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBDO15205 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBDO15205 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBDO15205 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBDO15205 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBDO15205 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBDO15205 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBDO15205 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBDO15205 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBDO15205 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBDO15205 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
UBDO15205 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBDO15205 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
UBDO15205 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
UBDO15205 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBDO15205 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBDO15205 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBDO15205 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBDO15205 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBDO15205 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBDO15205 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBDO15205 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBDO15205 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
UBDO15205 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBDO15205 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBDO15205 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBDO15205 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBDO15205 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBDO15205 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
UBDO15205 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBDO15205 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBDO15205 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBDO15205 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBDO15205 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBDO15205 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms