Protein–RNA interactions for Protein: B4E171

Tetraspanin, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4E171 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4E171 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4E171 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4E171 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4E171 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4E171 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4E171 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4E171 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4E171 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4E171 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4E171 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4E171 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4E171 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
B4E171 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4E171 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4E171 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4E171 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4E171 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4E171 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4E171 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4E171 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4E171 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
B4E171 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4E171 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
B4E171 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4E171 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4E171 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
B4E171 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4E171 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4E171 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4E171 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4E171 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4E171 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4E171 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
B4E171 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4E171 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4E171 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4E171 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4E171 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4E171 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4E171 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4E171 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4E171 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4E171 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4E171 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4E171 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4E171 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4E171 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
B4E171 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4E171 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4E171 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4E171 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4E171 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4E171 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4E171 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
B4E171 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4E171 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4E171 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
B4E171 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
B4E171 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
B4E171 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
B4E171 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
B4E171 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
B4E171 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
B4E171 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
B4E171 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
B4E171 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
B4E171 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
B4E171 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
B4E171 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
B4E171 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
B4E171 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
B4E171 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
B4E171 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
B4E171 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
B4E171 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
B4E171 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
B4E171 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
B4E171 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
B4E171 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
B4E171 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
B4E171 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
B4E171 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
B4E171 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
B4E171 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
B4E171 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
B4E171 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
B4E171 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
B4E171 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
B4E171 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
B4E171 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
B4E171 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
B4E171 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
B4E171 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
B4E171 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4E171 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4E171 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4E171 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4E171 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4E171 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms