Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
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