Protein–RNA interactions for Protein: A4D1E1

ZNF804B, Zinc finger protein 804B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF804BA4D1E1 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF804BA4D1E1 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF804BA4D1E1 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF804BA4D1E1 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF804BA4D1E1 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF804BA4D1E1 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF804BA4D1E1 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF804BA4D1E1 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF804BA4D1E1 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF804BA4D1E1 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF804BA4D1E1 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF804BA4D1E1 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF804BA4D1E1 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF804BA4D1E1 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ZNF804BA4D1E1 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ZNF804BA4D1E1 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF804BA4D1E1 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF804BA4D1E1 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF804BA4D1E1 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF804BA4D1E1 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF804BA4D1E1 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF804BA4D1E1 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF804BA4D1E1 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF804BA4D1E1 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF804BA4D1E1 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF804BA4D1E1 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF804BA4D1E1 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF804BA4D1E1 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF804BA4D1E1 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF804BA4D1E1 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF804BA4D1E1 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF804BA4D1E1 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF804BA4D1E1 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF804BA4D1E1 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF804BA4D1E1 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF804BA4D1E1 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF804BA4D1E1 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF804BA4D1E1 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF804BA4D1E1 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF804BA4D1E1 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF804BA4D1E1 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF804BA4D1E1 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF804BA4D1E1 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF804BA4D1E1 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF804BA4D1E1 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF804BA4D1E1 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF804BA4D1E1 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF804BA4D1E1 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF804BA4D1E1 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF804BA4D1E1 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF804BA4D1E1 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF804BA4D1E1 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF804BA4D1E1 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF804BA4D1E1 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF804BA4D1E1 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF804BA4D1E1 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF804BA4D1E1 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF804BA4D1E1 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF804BA4D1E1 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF804BA4D1E1 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF804BA4D1E1 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF804BA4D1E1 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF804BA4D1E1 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF804BA4D1E1 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF804BA4D1E1 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF804BA4D1E1 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF804BA4D1E1 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF804BA4D1E1 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF804BA4D1E1 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF804BA4D1E1 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF804BA4D1E1 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF804BA4D1E1 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF804BA4D1E1 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF804BA4D1E1 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF804BA4D1E1 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF804BA4D1E1 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF804BA4D1E1 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF804BA4D1E1 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF804BA4D1E1 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF804BA4D1E1 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF804BA4D1E1 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF804BA4D1E1 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF804BA4D1E1 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF804BA4D1E1 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF804BA4D1E1 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF804BA4D1E1 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF804BA4D1E1 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF804BA4D1E1 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF804BA4D1E1 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF804BA4D1E1 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF804BA4D1E1 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF804BA4D1E1 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF804BA4D1E1 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF804BA4D1E1 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF804BA4D1E1 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF804BA4D1E1 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF804BA4D1E1 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF804BA4D1E1 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF804BA4D1E1 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF804BA4D1E1 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms