Protein–RNA interactions for Protein: A2RU54

HMX2, Homeobox protein HMX2, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX2A2RU54 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms