Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
LINC00312Q9Y6C7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LINC00312Q9Y6C7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LINC00312Q9Y6C7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LINC00312Q9Y6C7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LINC00312Q9Y6C7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
LINC00312Q9Y6C7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LINC00312Q9Y6C7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LINC00312Q9Y6C7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LINC00312Q9Y6C7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
LINC00312Q9Y6C7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LINC00312Q9Y6C7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.74
LINC00312Q9Y6C7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LINC00312Q9Y6C7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LINC00312Q9Y6C7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LINC00312Q9Y6C7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LINC00312Q9Y6C7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LINC00312Q9Y6C7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LINC00312Q9Y6C7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LINC00312Q9Y6C7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LINC00312Q9Y6C7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LINC00312Q9Y6C7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LINC00312Q9Y6C7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LINC00312Q9Y6C7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LINC00312Q9Y6C7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LINC00312Q9Y6C7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
LINC00312Q9Y6C7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LINC00312Q9Y6C7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LINC00312Q9Y6C7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LINC00312Q9Y6C7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LINC00312Q9Y6C7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LINC00312Q9Y6C7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
LINC00312Q9Y6C7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LINC00312Q9Y6C7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LINC00312Q9Y6C7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LINC00312Q9Y6C7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LINC00312Q9Y6C7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LINC00312Q9Y6C7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LINC00312Q9Y6C7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LINC00312Q9Y6C7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LINC00312Q9Y6C7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
LINC00312Q9Y6C7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LINC00312Q9Y6C7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LINC00312Q9Y6C7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
LINC00312Q9Y6C7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
LINC00312Q9Y6C7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
LINC00312Q9Y6C7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
LINC00312Q9Y6C7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LINC00312Q9Y6C7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
LINC00312Q9Y6C7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
LINC00312Q9Y6C7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
LINC00312Q9Y6C7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
LINC00312Q9Y6C7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
LINC00312Q9Y6C7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
LINC00312Q9Y6C7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
LINC00312Q9Y6C7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
LINC00312Q9Y6C7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
LINC00312Q9Y6C7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
LINC00312Q9Y6C7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
LINC00312Q9Y6C7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
LINC00312Q9Y6C7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
LINC00312Q9Y6C7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
LINC00312Q9Y6C7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
LINC00312Q9Y6C7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
LINC00312Q9Y6C7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
LINC00312Q9Y6C7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
LINC00312Q9Y6C7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
LINC00312Q9Y6C7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
LINC00312Q9Y6C7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
LINC00312Q9Y6C7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
LINC00312Q9Y6C7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LINC00312Q9Y6C7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LINC00312Q9Y6C7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
LINC00312Q9Y6C7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
LINC00312Q9Y6C7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LINC00312Q9Y6C7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LINC00312Q9Y6C7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LINC00312Q9Y6C7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LINC00312Q9Y6C7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LINC00312Q9Y6C7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LINC00312Q9Y6C7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LINC00312Q9Y6C7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LINC00312Q9Y6C7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LINC00312Q9Y6C7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LINC00312Q9Y6C7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LINC00312Q9Y6C7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LINC00312Q9Y6C7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LINC00312Q9Y6C7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LINC00312Q9Y6C7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LINC00312Q9Y6C7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LINC00312Q9Y6C7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LINC00312Q9Y6C7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LINC00312Q9Y6C7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LINC00312Q9Y6C7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LINC00312Q9Y6C7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LINC00312Q9Y6C7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LINC00312Q9Y6C7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LINC00312Q9Y6C7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LINC00312Q9Y6C7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LINC00312Q9Y6C7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms