Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5J7

TIMM9, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim9, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM9Q9Y5J7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TIMM9Q9Y5J7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TIMM9Q9Y5J7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TIMM9Q9Y5J7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TIMM9Q9Y5J7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TIMM9Q9Y5J7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TIMM9Q9Y5J7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TIMM9Q9Y5J7 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TIMM9Q9Y5J7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TIMM9Q9Y5J7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TIMM9Q9Y5J7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TIMM9Q9Y5J7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TIMM9Q9Y5J7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TIMM9Q9Y5J7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TIMM9Q9Y5J7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TIMM9Q9Y5J7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TIMM9Q9Y5J7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TIMM9Q9Y5J7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TIMM9Q9Y5J7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TIMM9Q9Y5J7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TIMM9Q9Y5J7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TIMM9Q9Y5J7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TIMM9Q9Y5J7 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TIMM9Q9Y5J7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TIMM9Q9Y5J7 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TIMM9Q9Y5J7 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TIMM9Q9Y5J7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TIMM9Q9Y5J7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TIMM9Q9Y5J7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
TIMM9Q9Y5J7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TIMM9Q9Y5J7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TIMM9Q9Y5J7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TIMM9Q9Y5J7 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TIMM9Q9Y5J7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TIMM9Q9Y5J7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TIMM9Q9Y5J7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TIMM9Q9Y5J7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TIMM9Q9Y5J7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TIMM9Q9Y5J7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TIMM9Q9Y5J7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TIMM9Q9Y5J7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TIMM9Q9Y5J7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TIMM9Q9Y5J7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TIMM9Q9Y5J7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TIMM9Q9Y5J7 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TIMM9Q9Y5J7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TIMM9Q9Y5J7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TIMM9Q9Y5J7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TIMM9Q9Y5J7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TIMM9Q9Y5J7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TIMM9Q9Y5J7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TIMM9Q9Y5J7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TIMM9Q9Y5J7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TIMM9Q9Y5J7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TIMM9Q9Y5J7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TIMM9Q9Y5J7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TIMM9Q9Y5J7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TIMM9Q9Y5J7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TIMM9Q9Y5J7 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TIMM9Q9Y5J7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TIMM9Q9Y5J7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TIMM9Q9Y5J7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TIMM9Q9Y5J7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TIMM9Q9Y5J7 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TIMM9Q9Y5J7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TIMM9Q9Y5J7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TIMM9Q9Y5J7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TIMM9Q9Y5J7 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TIMM9Q9Y5J7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TIMM9Q9Y5J7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TIMM9Q9Y5J7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TIMM9Q9Y5J7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TIMM9Q9Y5J7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TIMM9Q9Y5J7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TIMM9Q9Y5J7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TIMM9Q9Y5J7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TIMM9Q9Y5J7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TIMM9Q9Y5J7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TIMM9Q9Y5J7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TIMM9Q9Y5J7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TIMM9Q9Y5J7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TIMM9Q9Y5J7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TIMM9Q9Y5J7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TIMM9Q9Y5J7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TIMM9Q9Y5J7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TIMM9Q9Y5J7 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TIMM9Q9Y5J7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TIMM9Q9Y5J7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TIMM9Q9Y5J7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TIMM9Q9Y5J7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TIMM9Q9Y5J7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TIMM9Q9Y5J7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TIMM9Q9Y5J7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TIMM9Q9Y5J7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TIMM9Q9Y5J7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TIMM9Q9Y5J7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TIMM9Q9Y5J7 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TIMM9Q9Y5J7 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TIMM9Q9Y5J7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TIMM9Q9Y5J7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms